Léon Berben est né en 1970 à Heerlen aux Pays-Bas mais vit à Cologne depuis de nombreuses années.
Il étudie l'orgue et le clavecin à La Haye (Koninklijk Conservatorium) et à Amsterdam (Sweelinck Conservatorium) auprès de Rienk Jiskoot, de Bob van Asperen, de Ton Koopman et de Gustav Leonhardt, et y obtient le diplôme de soliste.

Il est le claveciniste de Musica Antiqua Köln (Reinhard Goebel) dès mars 2000. Il donne au sein de cette formation des concerts en Europe, en Asie et en Amérique du Nord et du Sud, et enregistre de nombreux CDs pour Deutsche Grammophon / Archiv Produktion. Depuis la dissolution de l'ensemble fin novembre 2006, Léon Berben concentre son travail sur la musique de chambre et le répertoire solo.

Il donne des récitals au clavecin et à l'orgue. Ses enregistrements solos sur instruments historiques - essentiellement pour les labels Ramée et Aeolus - ont été encensés par la critique et ont obtenu de nombreuses récompenses, dont le Prix trimestriel de la Deutsche Schallplattenkritik et le « Choc » du Monde de la Musique.

Outre son activité de concertiste, Léon Berben s'engage par la publication d'articles dans des débats sur les pratiques d'exécution historiques. Il a ainsi signé comme co-auteur des articles pour Die Musik in Geschichte und Gegenwart.

Son répertoire s'étend de 1550 à 1750, mais son intérêt se porte principalement sur la musique allemande, les virginalistes et Sweelinck.
Il possède et joue trois clavecins, dont deux clavecins construits par Willem Kroesbergen (d'après Couchet et Stephanini) et un troisième construit par Keith Hill (d'après Zell).